Laura PIGNATA
Insegnamento di BIOINFORMATICS
Corso di laurea magistrale in DATA SCIENCE
SSD: BIO/18
CFU: 6,00
ORE PER UNITÀ DIDATTICA: 48,00
Periodo di Erogazione: Primo Semestre
Italiano
Lingua di insegnamento | INGLESE |
Contenuti | Concetti generali di biologia molecolare: DNA, RNA e proteine. Il genoma procariotico e eucariotico: struttura, composizione e regolazione. Sequenziamento del DNA: dalla sequenziamento Sanger al Next-Generation Sequencing . Database genomici e proteomici: GenBank e UniProt. Algoritmi di allineamento di sequenze (BLAST, FASTA). Browser del genoma: UCSC. Generazione di dati omici e pipeline bioinformatiche: analisi dei dati NGS. Varianti genetiche: identificazione e analisi strutturale/funzionale in silico. |
Testi di riferimento | Fondamenti di bioinformatica - Zanichelli |
Obiettivi formativi | Conoscenza e comprensione delle principali informazioni biologiche ottenute dall'analisi bioinformatica. |
Metodologie didattiche | Gli argomenti del corso saranno trattati con l'aiuto di presentazioni Power Point, video, esercitazioni in classe e lettura di articoli scientifici. |
Metodi di valutazione | L'esame consiste nel superare una prova orale. |
Altre informazioni | Il docente è disponibile per ricevimento degli studenti su appuntamento, da richiedere tramite email. |
Programma del corso | DNA: struttura e organizzazione; replicazione del DNA; Genoma: struttura e organizzazione; struttura dei cromosomi; il codice genetico |
English
Teaching language | English |
Contents | General concepts of molecular biology: DNA, RNA and protein. The procariotic and eucariotic genome: structure, composition and regulation. DNA sequencing: from Sanger Sequencing to Next-Generation Sequencing. Genomic and proteomic databases: GenBank and UniProt. Sequence Alignment algorithms (BLAST, FASTA). Genome browser: UCSC. Omics data generation and bioinformatics pipelines: NGS data analysis. Genetic variants: identification and structural/functional analysis in silico. |
Textbook and course materials | Bioinformatics for Beginners - Supratim Choudhuri |
Course objectives | Knowledge and understanding of the main biological information obtained by bioinformatics analysis. |
Teaching methods | The topics of the course will be treated with the help of Power Point presentations, video clips, classroom exercises, reading of scientific articles. |
Evaluation methods | The exam consists in passing an oral test. |
Other information | The teacher is available for reception students on request forwarded via email. |
Course Syllabus | DNA: structure and organization; DNA replication; Genome: structure and organization; Chromosome structure; the genetic code |